징병검사 일자/장소 본인 선택제 전면 실시
징병검사대상자는 직접 병무청 홈페이지에서 희망하는 징병감사일자와 장소를 선택할 수 있게 된다.
지금까지는 대학생에 한하여 방학기간 중에 징병검사 일자를 선택할 수 있었으나, 새해부터는 대학생, 학원수강생, 직장인으로서 학교 소재지 등 실거주지 지방병무청에서 징병검사를 받을 수 있다.
실거주지에서 징병검사를 받고자 하는 사람은 관할 지방병무청의 징병검사 기간 중 검사를 희망하는 날 5일전까지 인터넷으로 신청하면 된다.
시행시기 : 2006년 1월부터

신장에 의한 면제조항 신설
지금까지는 신장에 의한 면제조항이 없어 신장 158Cm 이하자는 일괄 4급 공익근무대상으로 판정하였으나, 새해부터는 신장에 의한 면제조항을 신설하여 145Cm 이하자는 5급(제2국민역)으로, 그리고 140Cm 이하자는 6급(병역면제)으로 각각 병역처분하게 된다.
시행시기 : 2006년 1월부터

병역의무부과 통지서 E-mail 교부
병역의무부과 통지서 교부방법이 신세대 취향에 맞게 개선된다. 지금까지는 모집병 합격자와 징병검사 본인선택자에게만 E-mail로 통지서를 교부하였으나, 새해부터는 모집병 합격자와 징병검사 본인선택자 뿐만 아니라 입영(소집)일자 본인선택자와 재학생입영원 출원자에게도 E-mail로 통지서를 교부하게 된다.
시행시기 : 2006년 1월부터

직계가족 복무부대 지원입대 제도 신설
할아버지, 아버지, 형제 등 직계가족(조모,모,자매도 포함)이 복무한 부대에서 군 복무를 하고자 할 때, 지원에 의하여 입영할 수 있다. 지원자격은 중졸 이상의 학력으로 현역입영대상자이면 가능하고, 지원가능 부대는 6·25전쟁 참전부대, 월남전 참전부대, 일반전방초소(GOP) 및 전방부대에 한하며, 도심권이나 후방부대는 제외된다.
시행시기 : 2006년 1월부터

육군 모집병 지원자격(학력) 완화
학력에 의한 육군 모집병 지원자격이 고졸 이상에서 중졸 이상으로 완화되어 고퇴, 중졸 학력자도 지원이 가능해진다.
시행시기 : 2006년 1월부터

공용화기병 입영부대 다양화
지금까지는 공용화기병 선발자의 입영부대를 육군훈련소로 한정하였으나, 새해부터는 102보충대, 306보충대 및 향토사단등으로 다양화된다.
시행시기 : 2006년 2월모집병부터 적용

공익수의사제도 신설
가축으로 인한 질병발생율이 높아짐에 따라 방역체계를 강화하고 가축위생 취약지역 주민의 보건위생에 대한 안전성을 확보하기 위해 방역기관 등 공익분야에 대체복무하는 공익수의사제도를 신설할 예정이다.
편입대상은 수의사 면허를 취득한 수의사관 후보생 중 수의장교로 선발되지 아니한 사람과 공익근무요원 소집대상 보충역이다. 복무기간은 3년으로 가축방역, 동물검역, 축산물위생 등 의 업무를 수행하게 되며, 지방자치단체 및 소속 가축위생시험소, 동물검역기관 등에 근무하게 된다.
시행시기 : 2006년 중 시행

국외여행 귀국신고제도 폐지
병역의무자가 국외여행을 마치고 귀국할 경우, 귀국일로부터 30일 내에 공항(항만) 출귀국신고사무소 또는 지방병무청을 방문하거나 인터넷으로 귀국신고를 하여야 했으나, ‘06년 10월 이후 부터는 별도의 귀국신고를 하지 않아도 된다.(법무부 출입국 전산자료에 의거 직권으로 귀국사실 정리)
시행시기 : 2006년 10월부터